L-5-MTHF-Ca keemiline struktuur on järgmine:

Nagu näha, koosneb L-5-MTHF-Ca kolmest põhikomponendist: metüülitud tetrahüdrofolaadist, vasakule pööravast isomeerist ja kaltsiumioonist. Metüülitud tetrahüdrofolaat on vitamiini B9 derivaat, mis koosneb metüülrühmaga p-aminobensoehappest ja glutaarhappest, mida saab organismis redutseerida tetrahüdrofolaadiks ja seega osaleda raku ainevahetusprotsessides. Vasakule pöörav isomeer on molekul, mille stereokonfiguratsioon on olemuselt vasakule pöörav ja mis erineb struktuurilt paremale pööravast isomeerist, kuid neil on täpselt sama keemiline valem. Kaltsiumiioon on oluline anorgaaniline ioon, millel on kehas mitmesuguseid füsioloogilisi funktsioone, näiteks luude tervise säilitamine ja neuromuskulaarne ülekanne.
StruktuurL-5-MTHF-Caannab talle hea biosaadavuse ja bioaktiivsuse, võimaldades tõhusalt osaleda organismis toimuvates ainevahetusprotsessides ning omada ennetavat ja ravitoimet paljude haiguste puhul. Seetõttu on seda laialdaselt kasutatud farmaatsiatoodetes ja toitainetes.
Magnafolaatvõib imenduda otse, ainevahetus puudub, sobib igat tüüpi inimestele, sealhulgas MTHFR geenimutatsiooniga.